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-	'''Installing Kai system,<br>E.coli starts oscillating!'''	+	'''Kaiシステムを大腸菌に導入し,<br>周期的自律振動を行わせる!'''
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-	= Kai system =	+	= Kaiシステム =
	[[Image:Kai system.jpg|right|400px]]<br />		[[Image:Kai system.jpg|right|400px]]<br />
-	Kai system is generated by 3 proteins(KaiA,KaiB, and KaiC).<br />	+	Kaiシステムとは３つのたんぱく質(KaiA,KaiB, and KaiC)によってつくられる<br />
-	This is the most simplest circardian oscillation system.<br />	+	最も単純で、分子レベルでの解明の進んでいる振動システムである。<br />
-	But,it is not known how this oscillation regulate global expression of many proteins in cyanobacteria.	+	しかし、シアノバクテリア内でこの振動がどのようにタンパク質の発現を制御しているかは分かっていない。
	<br />		<br />
-	SasA is a Sensory Kinase(a kind of Histidine Kinase).<br />	+	SasAはセンサーキナーゼであり、ヒスチジンキナーゼ(HK)の１種であり、<br />
-	SasA is believed to connect with Kai cycle and transcriptional oscillation of many proteins.<br />	+	Kaiサイクルとタンパク質の周期的翻訳を繋ぐ役割を持っていると考えられている。<br />
-	RpaA is coganate response regulator for SasA, and it's deletion results in the complete loss of transcription oscillation.<br />	+	RpaAは2006年に発見されたSasAのレスポンスレギュレーター(RR)であり、<br>
-	This is all known about Kai.	+	''rpaA''欠損株では周期的翻訳が完全に消失する。<br />
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-	'''reference '''	+
		+
		+	'''文献 '''
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-	= E.colock Project =	+	= E.colock プロジェクト =
-	SasA and RpaA is highly homologous to EnvZ and OmpR,respectively.	+	SasAとRpaAは大腸菌のEnvZとOmpRにそれぞれ高い相同性を示している。
-	Believing that SasA is communicating with Kai oscillator.	+	SasAがKai振動と作用し、RpaAがSasAにより活性化を受けると確信し、
-	Believing that RpaA communicate with SasA.	+	RpaA-OmpRキメラをつくる。
-	We designed RpaA-OmpR chimera,in hope that we read our Kai oscillation using ''ompC'' promoter.	+	このRpaA-OmpRキメラにより、Kaiシステムの振動を ''ompC'' プロモーターを使い観測する。
	[[Image:Ecolock.jpg|right|400px]]<br />		[[Image:Ecolock.jpg|right|400px]]<br />
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-	= Chimera design =	+	= キメラデザイン =
	In general, Response Regulator has 2 domeins,		In general, Response Regulator has 2 domeins,

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Revision as of 14:02, 15 November 2006

Contents 1 E colock "self-cycling-E. coli" 2 Concept 3 Member 4 Kaiシステム 5 E.colock プロジェクト 6 キメラデザイン 7 Next step (＊_＊)/ 8 Last up date

E colock "self-cycling-E. coli"

⇒Go to "E colock" English page??
wikiページ（英語）

Concept

Kaiシステムを大腸菌に導入し,
周期的自律振動を行わせる!

Member

Chiba 2006　wikiページ（英語）
[http://chem.tf.chiba-u.jp/igem/ iGEM　Chiba　オフィシャルページ（日本語）]

『む』チーム

• 奥山　真平
• 方波見　彰仁
• 菅谷　紗里
• 松野　伸哉

Kaiシステム

Kaiシステムとは３つのたんぱく質(KaiA,KaiB, and KaiC)によってつくられる
最も単純で、分子レベルでの解明の進んでいる振動システムである。
しかし、シアノバクテリア内でこの振動がどのようにタンパク質の発現を制御しているかは分かっていない。
SasAはセンサーキナーゼであり、ヒスチジンキナーゼ(HK)の１種であり、
Kaiサイクルとタンパク質の周期的翻訳を繋ぐ役割を持っていると考えられている。
RpaAは2006年に発見されたSasAのレスポンスレギュレーター(RR)であり、
rpaA欠損株では周期的翻訳が完全に消失する。

文献

E.colock プロジェクト

SasAとRpaAは大腸菌のEnvZとOmpRにそれぞれ高い相同性を示している。

SasAがKai振動と作用し、RpaAがSasAにより活性化を受けると確信し、

RpaA-OmpRキメラをつくる。

このRpaA-OmpRキメラにより、Kaiシステムの振動を ompC プロモーターを使い観測する。

キメラデザイン

In general, Response Regulator has 2 domeins,

regulator domein receives phospate from Hiatidine Kinase and effector domein bind to specific sequence of DNA.

We create 36 chimera of RpaA-OmpR.

There are different in cutting point, but all of them have recerver domein of RpaA to communicate SasA,and DNA-binding domein of OmpR to bind and activete right to OmpC promoter.

The precedure(↓)

We used 6 excite primers on each RpaA and OmpR， It can make 6 ×6 = 36 different chimeras!!

Next step (＊_＊)/

The construct of chimeras is finished! Chimaras along with WT RpaA and OmpR will be tested in their function as response regulator that switch ON/OFF the ompCpromoter.

We will find some chimeras indeed pick up Kai cycle.

Last up date

• 11/15